Samtoolsが動かなくなったときは新しい仮想環境を作ってsamtools専用にする

22/11/23追記

以下の記事は古いもので、dockerを使えば無問題ということがわかりました。せっかく書いたので残しておきます。dockerについては以下の記事にしました。

shioiyan.hatenablog.com

 

 

起こった現象

• anacondaに入れているsamtoolsが動かない。エラーメッセージはReason: image not found.

• うまくいっても、他のライブラリを入れた瞬間にだめになる。

解決策

• 新しい仮想環境を作ってsamtools専用にする。
• かなりいろいろ試したけどこれしかなかった。
• 試行錯誤した結果、consa uninstall samtoolsしようとしてもsolvingがずっと続いて進まないことがある→conda remove --force

以上